Конечно, надо учитывать!
Хорошо, если имя и отчество будут одной "национальности". Иван Шамсутдинович звучит так же странно, как и Шарлотта Александровна.
Если имя заканчивается на гласную, хорошо чтобы отчество начиналось с согласной и наоборот. Если в конце имени и начале отчества повторяются слоги, бывает сложно выговорить. Например Анна Анатольевна.
Иногда повторяющиеся буквы в имени и отчестве красиво, иногда нет. Мне пришлось отказаться от имени для дочери Кристина Константиновна - звучит трудновато. А вот Анастасия Константиновна - очень мелодично.